NT FASTA近億等級數量索引
情境說明，自己玩的專案中需要建立NT資料庫
並且需要經過資料清洗，像是將資料庫分成human和non human的fasta 並將無taxon分類的sequences排除
可怕的是目前的NT的序列數 …
Python
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Makura v1.2.0 更新說明
Makura的功能介紹可以看上一篇
Makura安裝與使用 - 批量下載NCBI genomes
bash 1 pip install makura==1.2.0 這篇介紹1.0.0到1.2.0之間增 …
Makura安裝與使用 - 批量下載NCBI genomes
Introduction 目的是要一次大量下載NCBI的assembly genome
Q：這種需求什麼時候會用上呢？
A: 生物資訊分析genomics或metageomics資料常會需要下載指定 …
Ubuntu 22.04 setup after installation
The following setup is my customization while ubuntu initialization
Operating System Input method …
生物資訊的side project
如果要做對應徵生物資訊職缺有幫助的 side project
我認為有幾個方向可以考慮
打包python套件上傳PyPI
依賴套件管理 專案中的python package我是用poetry管理
好處是可以分開開發時才使用的套件跟程式執行時依賴的套件
移除不用的套件時還可以確認依賴套件的依賴套件也全部被移除了
這點 …